PROTEUS Structure Prediction Server 2.0
Comprehensive 2D and 3D structure predictions
 
 
 
PROTEUS2 prediction (ID=3805625) complete
Summary:
 
  • Time of Submission:
  • Sequence Name: None given
  • Number of residues read in: 147
  • Sequence does not contain a transmembrane helicle region.
  • Sequence does not contain a signal peptide.
  • Number of useable PDB homologs found: 3
    • 1W7DA , e-value = 1.0E-62
    • 1X3BA , e-value = 2.0E-16
    • 1NYOA , e-value = 3.0E-16
  • Number of sequence alignments used for ab-initio predictions: 49
  • Overall confidence value: 78.7%
  • Predicted % Helix content: 29 % (43 residues)
  • Predicted % Beta sheet content: 31 % (45 residues)
  • Predicted % Coil content: 40 % (59 residues)
  • Predicted % Signal peptide content: 0 % (0 residues)
  • Predicted % membrane content: 0 % (0 residues)
  • Homology modelling was successful
Graphical Alignment of Soluble PDB Homologs:

Conserved Domains
Legend:
  H = Helix
E = Beta Strand
C = Coil
T = Membrane helix
B = Membrane strand
S = Signal peptide
c = Cleavage site
Line 1 = sequence (single letter IUPAC code, 60 characters per line)
Line 2 = secondary structure (H, E or C)
Line 3 = confidence score (0-9, 0 = low, 9 = high)


Predicted Complete Secondary Structure:
  A '*' character above the overall prediction indicates the homolog's structure was used at this residue.
   1  ************************************************************ 60
      DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAADAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGTVDELLK
     
CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHHCCCCHHHHHHC
      973678999985868999999999455444678978999985775555556457788864

  61  ************************************************************ 120
      PDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSISQPEVE
     
HHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEEECCEEECCCECC
      675789999999854466676578878879998589979999869986799998588888

 121  *****   ******************* 147
      EVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA
     
CEEEEEECCCCCCEEEEEECCCCCCCC
      699997578889879999755557888



Predicted Signal Peptide Structure (only showing first 60 residues):
 
No signal peptide found

Predicted Transmembrane Structure:
 

No transmembrane region found



Detailed Prediction Information:
 
    Proteus2 uses a "Jury of Experts" approach involving predictions from PSIPRED ( Jones, 1999 ), JNET ( Barton et al., 2000), TRANSSEC (a locally developed tool), and structural alignment ( XALIGN ). Following is the predicted secondary structure from each component.

PSIPRED
   1  DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAADAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGTVDELLK 60
     
CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCEEEEEECHHHHHHCCHHHHHHHCC
      966889999978887799999988687679758998899975989997789556877559

  61  PDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSISQPEVE 120
     
CCCHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEEEEEEECCCCCC
      778899999998655565444444467867675479878999789856654566665577

 121  EVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA 147
     
CEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCC
      547764575658898999565658999



JNET
   1  DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAADAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGTVDELLK 60
     
CCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHC
      861167888706771789999986798120179997278713831320588114677641

  61  PDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSISQPEVE 120
     
CCCHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCCEEEEEEECCEEC
      899478999998642023000378877751675188716887538852333565300230

 121  EVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA 147
     
CEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCC
      157864234469975888631108999



TRANSSEC
   1  DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAADAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGTVDELLK 60
     
CCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHEEEEEEECCCCCEEEEECCCCCCCEECCCEEEEEEC
      998656888568875445555544444555458874899867888543445674565665

  61  PDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSISQPEVE 120
     
CCCCCCEEEEEEEEEEECCCEEHHEECCCEEEEECCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEEEEC
      887654357899988656654433335655788668789999868865465578655666

 121  EVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA 147
     
CEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCC
      567897545477887887777666989



JURY-OF-EXPERTS PREDICTION
   1  DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAADAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGTVDELLK 60
     
CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHC
      973678999985868999999999455444678978999985775555556457788864

  61  PDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSISQPEVE 120
     
CCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEEECCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCC
      675789999999854466676578878879998589979999869986799998588888

 121  EVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA 147
     
EEEEEEECCCCCCEEEEEEEEECCCCC
      699997578889879999755557888

3D-TO-2D MAPPING FOR TOP-SCORING HOMOLOG:

QUERY DTGEIVDTATGAGSFTTLLTAA------DAAGLVETLKGEGPFTVFAPTEAAFAALPDGT 54
1W7DA ETGDIVETATGAGSFTTLLTAA------EAAGLVDTLKGDGPFTVFAPTDAAFAALPEGT
      CCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHH~~~~~~HHHCHHHHHHCCCEEEEEEECHHHHHHCCCCH
1X3BA ~~GTVMDVLKGDNRFSMLVAAI------QSAGLTETLNREGVYTVFAPTNEAFRALPPRE
      ~~CCHHHHHHHCCCCHHHHHHH~~~~~~HHHCHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHCCCHH
1NYOA ~~~~~~~~~~~~~~~~TTLTAALSGQLNPQVNLVDTLNS-GQYTVFAPTNAAFSKLPAST
      ~~~~~~~~~~~~~~~~HHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHCC~CEEEEEEEEHHHHHHCCHHH


  55  VDELLKPDNKDKLTDILTYHVVPGDVMSSELTDGMTADTVDGGALTVTLDGGPKVNGVSI 114
1W7DA VEDLLKPENKEKLTEILTYHVVPGEVMSSDLTEGMTAETVEGGALTVTLEGGPKVNGVSI
      HHHHHCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCEEEEEECCCCEEECCEEE
1X3BA RSRLL--GDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVSL----KNNVVSV
      HHHHH~~HHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEE~~~~CCCEEEE
1NYOA IDEL--KTNSSLLTSILTYHVVAGQTSPANVVG--TRQTLQGASVTVTGQG----NSLKV
      HHHH~~HCCCCHHHHHHHHCEEEECCCCCCCCC~~EEEECCCEEEEEECCC~~~~CEEEE


 115  SQPEVEEVEKVNGSISASNGVIHVIEGVLMPGA 147
1W7DA SQPDVD----------ASNGVIHVIDGVLMPGA
      CCCEEE~~~~~~~~~~CCCEEEEEECCCCCCCC
1X3BA NKEPVAEPD-----IMATNGVVHVITNVLQP~~
      CCEEEECCC~~~~~CCCCCCEEEEEECCCCC~~
1NYOA GNADV-----VCGGVSTANATVYMIDSVLMPPA
      CCEEE~~~~~EEECCCCCEEEEEEEECCCCCCC




PSI-BLAST ALIGNMENTS - 49 SEQUENCES USED BY JNET, TRANSSEC, and PSIPRED
Blast e-value: 9.0E-40
1   >gi|37523621|ref|NP_926998.1| hypothetical protein glr4052 [G
match: ~~ASIVD---TA------V----Q---------A--G--T----FK-------T----LAQ---A-----------L------T-----A----A--D-----L-----V-----DT-----L-----K------G-----S--G---P---F----TVFA-PTDDA----F-Q--------S-L-----P---AG-----------T--LNDLL----KPE--NKSKL-------AN-ILKY-----------H--VV-S----G-K----V-M-S-S------D---I-------K-------P-----------------------G---------------N-------------------------V-------A--T---V---A-----------GE------S------I----SI--QT--------------------Q-G--QQ-V--------------------------------------------------------------------------M---------------V--------------N--E----------A-----------R-VT--K--AD-IAAD----N---------------GV-IHVIDKVL--L-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 3.0E-39
2   >gi|27375618|ref|NP_767147.1| bll0507 [Bradyrhizobium japonic
match: ~SKNIVQ---NA------V----N---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----PT-----L-----E------S-----K--G---P---F----TVFA-PTNAA----F-G--------K-L-----P---AG-----------T--VDNLV----KPE--NKATL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-S------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---A---E-----------GE------E------L----TV--KK--------------------M-D--GK-TW-------------I--------------------------------------V-D----------A-------K---------------G--------------G--T----------S-----------M-VT--I--SN-VNQS----N---------------GV-IHVVDTVL--M-PA~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 5.0E-37
3   >gi|3282161|gb|AAC24944.1| BIGH3 [Homo sapiens]
match: ~~GTVMD---VL------K----G---------D--N--R----FS-------M----LVA---A-----------I------Q-----S----A--G-----L-----T-----ET-----L-----N------R-----E--G---V---Y----TVFA-PTNEA----F-R--------A-L-----P---PR-----------E--RSRLL------G--DAKEL-------AN-ILKY-----------H--IG-D----E-I----L-V-S-G------G---I-------G-------A-----------------------L---------------V-------R-----------------L-------K--S---L---Q-----------GD------K------L----EV--SL--------------------K-N--NV-V--------------------------------------------------------------------------S---------------V--------------N--K----------E-----------P-VA--E--PD-IMAT----N---------------GV-VHVITNVL--Q-PPA
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 1.0E-36
4   >gi|17229311|ref|NP_485859.1| hypothetical protein [Nostoc sp
match: ~~~NIVA---LA------A----S---------S--N--S----FS-------T----LTT---L-----------L------R-----T----A--G-----L-----T-----DI-----L-----E------Q-----P--G---P---Y----TVFA-PTNEA----F-A--------A-L-----P---AG-----------T--LEQLQ----QPQ--NRELL-------VR-ILRY-----------H--VV-P----G-Q----L-T-A-N------Q---L-------S-------S-----------------------G---------------Q-------------------------L-------T--T---A---S-----------DA------P------V----NV--RV--------------------D-----------------T---AN--------------------------------------N-Q----------I-------A---------------V--------------N--E----------A-----------R-VV--Q--AN-IQAS----N---------------GV-IHAINEVL--I-PP~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 2.0E-36
5   >gi|13474037|ref|NP_105605.1| similar to transforming growth
match: ~~KNIVE---NA------V----N---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----ET-----L-----Q------G-----A--G---P---F----TVFA-PTNEA----F-A--------A-L-----P---AG-----------T--VDTLL----KPE--NKDKL-------TK-ILTC-----------H--VI-G----A-K----A-M-A-A------D---V-------T-------A-----------------------M---------------AKADGGTHK-----------------V-------K--T---V---G-----------GC------E------L----SL--KA--------------------E-G--GK-----------V---TV--------------------------------------T-D----------E-------N---------------G--------------N--V----------A-----------N-VT--I--AD-VEQS----N---------------GV-IHVIDKVL--L-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 2.0E-36
6   >gi|23129937|ref|ZP_00111758.1| COG2335: Secreted and surface
match: ~~KNLLA---LA------E----S---------N--A--S----FT-------T----LTK---A-----------L------K-----A----A--G-----L-----T-----GA-----L-----Q------G-----K--D---N---L----TIFA-PTDAA----F-A--------K-L-----P---AD-----------A--LQELL----NPA--NKEVL-------LK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----V-L-S-T------D---L-------K-------S-----------------------G---------------E-------------------------V-------K--S---L---E-----------GG------A------I----NV--KV--------------------D-P--S--------------------------------------------------------T-G----------V-------T---------------V--------------N--D----------A-----------K-VT--Q--PD-ITAS----N---------------GV-IHAIDQVI--L-PP~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 7.0E-36
7   >gi|17231289|ref|NP_487837.1| hypothetical protein [Nostoc sp
match: DSKNLLE---LV------E----S---------N--S--S----FT-------T----LNK---A-----------L------Q-----A----A--G-----L-----T-----ET-----L-----K------G-----K--D---N---L----TIFA-PTDAA----F-A--------K-L-----P---QD-----------A--LQALL----QPD--NKEVL-------LK-VLTY-----------H--VV-P----G-N----V-L-S-T------D---L-------K-------S-----------------------G---------------E-------------------------V-------K--S---V---E-----------GG------T------I----NV--KV--------------------D----------------------T--------------------------------------Q-G----------V-------S---------------V--------------N--D----------A-----------K-VT--Q--AD-IKAS----N---------------GV-IHVIDTVI--L-PA~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 1.0E-35
8   >gi|25026619|ref|NP_736673.1| conserved hypothetical protein
match: ~~~DIVD---TA------A----G---------A--G--S----FN-------T----LVT---A-----------I------Q-----A----A--G-----L-----E-----ET-----L-----R------G-----D--G---P---F----TVFA-PTDEA----F-N--------A-L-----P---EG-----------T--LDALL-----AD--PQGDL-------TE-ILTY-----------H--VV-D----G-E----V-F-A-A------D---VLE-----M-------D-----------------------G---------------Q-------T-----------------V-------E--T---L---Q-----------GG------T------F----TV--EI--------------------E-G--E-----N------V---VL--------------------------------------V-D----------T-------A---------------G--------------N--R----------V-----------N-VT--D--TD-IEAS----N---------------GV-IHVVDTVL--S-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 6.0E-34
9   >gi|17934385|ref|NP_531175.1| conserved hypothetical protein
match: ENKNIVE---NA------M----N---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----ET-----L-----Q------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNEA----F-A--------A-L-----P---KG-----------T--VENLL----KPE--NKAQL-------TK-VLTC-----------H--VV-E----A-D----A-M-S-K------T---I-------E-------K-----------------------M---------------I-------KDDKGTHD----------V-------K--T---V---G-----------GC------I------L------------------------------K-A--KE-SMDK------I---TL--------------------------------------T-D----------E-------M---------------G--------------G--V----------A-----------H-VT--I--AD-VKQS----N---------------GV-IHVIDKVL--L-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 6.0E-34
10  >gi|9937355|gb|AAG02420.1| 30 kDa yolk granule protein YP30 [
match: ~~~DIVQ---QL------R----A---------L--G-------LR-------E----AAN---I-----------A------E-----Q----V--D-----L-----R-----QI-----L-----R------D-----G--DLS-S---V----TLCM-PSDKA----V-Q--------K-W-----R---QE--------------LPAKL----RPD--QEA-M-------RN-LVKA-----------W--AV-S----G-R----V-E-S-S------Q---I-------T-------D-----------------------N---------------Q-------K-----------------V-------Q--S---L---N-----------GA------K------L----RF--NV--------------------Y-R--DS-K-----------------------------------------------------K-M----------I-------T---------------V--------------N--G----------A-----------R-VI--D--AD-RNAS----S---------------GL-VHVVDKVI--Y-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 7.0E-34
11  >gi|5689333|dbj|BAA82956.1| EBP-alpha [Anthocidaris crassispi
match: ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AN---I-----------A------Q-----Q----V--D-----L-----R-----QI-----L-----R------D-----S--GLS-S---V----TLCM-PSDKA----V-Q--------K-W-----R---RE-----------L--PERLR----P----DTEAL-------KK-LVKA-----------W--IV-P----G-R----L-E-S-S------Q---L-------G-------D-----------------------N---------------K-------K-----------------V-------Q--S---L---N-----------GA------K------L----RF--NV--------------------Y-N--DV-K-----------------------------------------------------K-I----------V-------T---------------V--------------N--G----------A-----------R-IT--D--AD-RTMN----S---------------GL-IHEVDKVI--Y-P~~
query: ~SKTIVE---NA------A----K---------S--K--D----HT-------T----LVA---A-----------V------K-----A----A--G-----L-----V-----KT-----L-----D------G-----K--G---P---F----TVFA-PTNMA----F-D--------K-L-----P---AG-----------T--VETLI----KPE--NKAQL-------TK-ILTY-----------H--VV-P----G-K----L-E-A-A------D---L-------T-------D-----------------------G---------------K-------K-----------------L-------K--T---V---E-----------GE------T------L----TV--KR--------------------M-G--DQ-----------V---TL--------------------------------------I-D----------A-------K---------------G--------------G--S----------S-----------T-VT--I--PN-VNQS----N---------------GV-IHVIDTVL--M-P~~

    
Blast e-value: 5.0E-33
12  >gi|27377585|ref|NP_769114.1| blr2474 [Bradyrhizobium japonic
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27  >gi|23009052|ref|ZP_00050246.1| COG2335: Secreted and surface
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28  >gi|24646161|ref|NP_731661.1| midline fasciclin CG3359-PB [Dr
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29  >gi|33386210|emb|CAD79334.2| putative hyaluronan receptor for
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30  >gi|7287821|gb|AAF44859.1| hypothetical protein [Drosophila m
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31  >gi|21553590|gb|AAM62683.1| arabinogalactan protein-like [Ara
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33  >gi|7484725|pir||T09841 hypothetical protein - upland cotton
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34  >gi|34864902|ref|XP_235015.2| similar to stabilin-2 [Rattus n
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36  >gi|2129473|pir||S52995 arabinogalactan-like protein - loblol
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38  >gi|21536777|gb|AAM61109.1| unknown [Arabidopsis thaliana]
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39  >gi|25143046|ref|NP_740907.1| Beta-Ig-H3/Fasciclin domain con
match: ~~~SLWE---IM------R----N---------E--S--RIQASFH-------M----MSN---L-----------Q------L-----R----Y--S-----M-----DPW---QV-----L-----T------P-----E--Q---N---F----TFFV-PTNEA----W-H--------K-Q-----S---TS-----------L--VARMN----DGN--HWQAL-------QY-VYKR-----------H--IV-Q----G-QA---L-M-Y-T------D---L-------R-------E-----------------------R---------------T-------Y-----------------V--------------M---M-----------ND------E-----------KV--VI--------------------R-R--RG-RFFE------L---YW--------------------------------------P-R----------G-------D---------------R--------------R--A----------Q-----------V-LE--G--GE-IAGI----N---------------GY-MHMIDSVL--I~~~~
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40  >gi|321051|pir||B60672 blastula butanol-extractable protein 4
match: ~~~~~VQ---TV------S----D---------V--E--A----FR-------------RS---L-----------I------S-----E----A--K-----L-----V-----SQKF---L-----A------D-----A--D---P---I----TVLV-PTNKA----F-K--------A-L-----P---AG-----------V--LEDLK----KKNRPNSKTC-------SN-I--------------------S----D-L----D-V-N-T------V---I-------L-------S-----------------------R---------------Q-------R-----------------I-------R--A---L---Q-----------GD------E------I----SV--TL--------------------N-E-------------------VM--------------------------------------R-N----------M-------E---------------R--------------D--I----------C-----------T-AI--D--PA-ITTN----H---------------GV-IHVIDRVL--V~~~~
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41  >gi|27819499|gb|AAO24903.1| putative arabinogalactan-protein
match: ~~KDFIQ---TL------L----K---------Y--G--G----YN-------ELADIFVN---L-----------T------SL----A----T--E-----L-----A-----QL-----V-----S------E-----G--Y---A---L----TVLA-PNDEA----M-A--------R-L-----T---AD-----------Q--LSEPG----SPE--N--------------ILYY-----------H--MI-P----E-Y----Q-T-E-E------S---M-------Y-------NAVRRFG-----------------K---------------V-------R-----------------Y-------D--T---L---R-----------LP------H------K----VV--AR--------------------E-A--DG-SVKF----------------------------------------------------G----------H-------G---------------E--------------G--S----------A-----------Y-LF--D--PD-IFAD----G---------------RISVQGIDAVL--F-PPA
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42  >gi|32418898|ref|XP_329927.1| hypothetical protein [Neurospor
match: ~~GSIPS---TL------S----L---------F--P--N----LS-------N----LTA---L-----------L------T-----Q----S--S-----L-----A-----GP-----V-----S------E-----A--A---G---I----TVLA-PDDSA----F-A--------A-V-----N---IS-----------A--LTD-------------EQI-------VG-ILSQ-----------H--VI-V----D-Y----VGY-S-P------L---L-------K-------D-----------------------G---------------Q-------V-----------------F-------K--T---L---A-----------NG------T------I----TV-----------------------------------A------V---RD--------------------------------------S-G----------V-------Y---------------F--------------N--G----------A-----------K-VT--A--SD-VIVE----N---------------GV-VHTV~~~~~~~~~~~
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43  >gi|24647502|ref|NP_732165.1| Fasciclin 1 CG6588-PB [Drosophi
match: ~~~NALK---FL------K----N---------A--E--E----FNVDNIGVRT----YRS---Q-----------V------T-----M----A--K-----K-----E-----SV-----Y-----D------A-----A--G---Q---H----TFLV-PVDEG----F-K--------L------------S-----------A--RSSLV----DG----------------K-VIDG-----------H--VI-P----N-T----V-I-F-TAAAQHDD---P-------K-------A-----------------------S---------------A-------A-----------------F-------E--D---L---L-----------KV------T------V----SFFKQK--------------------N-G--KM-YVKS------N---TI--------------------------------------V-G----------DAKHRV--G---------------V--------------V--L----------A-----------E-IV--K--AN-IPVS----N---------------GV-VHLIHRPL--M~~~~
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44  >gi|29349571|ref|NP_813074.1| conserved hypothetical protein
match: ~~GTAWE---VL------S----N---------EYGG--K----FS-------M----FLE---A-----------A------E-----L----S--G-----F-----K-----PI-----L-----D------G-----K--S---V---A----TVMA-PDNDA----F-A--------A-Y-----L---EE-----------H--GYVSV----KDI--PTDDL-------KK-LIGY-----------H--LI-Y----Y-S----Y-S-K-S------D---L-------E-------NFRPEDSATSKDDDDDDELGVLQPG---------------MYY-----K-----------------F-------R--T---H---S-----------TS------P------I----TK--EV--------------------D----PS-TNNT------V---TVYHLERFLPVFSHHIFASKGIDAKKNYEFFYPNSTWTGDN-G----------F-------N---------------V--------------S--N----------A-----------S-VK--E--YQ-IITN----N---------------GY-IYNVDRVL--E-P~~
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45  >gi|31200425|ref|XP_309160.1| ENSANGP00000018604 [Anopheles g
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46  >gi|32412123|ref|XP_326542.1| predicted protein [Neurospora c
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48  >gi|7489729|pir||T04348 endosperm specific protein SC3 - maiz
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